Il mercato degli hotel economici di Kyoto si concentra su due zone: l'area della stazione di Kyoto e il quartiere di Nakagyo (centrale). Entrambe offrono il miglior rapporto qualità-prezzo in città, con le proprietà nell'area della stazione particolarmente convenienti per gite di un giorno a Osaka, Nara e Uji.
La categoria degli hotel business giapponesi — marchi come Dormy Inn, Toyoko Inn e APA Hotel — rappresenta la spina dorsale dei viaggi economici a Kyoto. Le camere sono compatte ma ingegnerizzate con precisione, con eccellente insonorizzazione, docce potenti e wifi gratuito. Le tariffe vanno da ¥8.000 a ¥15.000 (circa €50–€95) a notte per una singola ben attrezzata, con opzioni doppie e matrimoniali a modesti sovrapprezzi. Molti includono un'opzione di colazione giapponese (riso, miso, pesce alla griglia) a ¥700–¥1.200 che vale la pena provare.
Per i viaggiatori che desiderano un tocco di carattere tradizionale a prezzi economici, proprietà ibride come The Gate Hotel Kyoto offrono un design influenzato dal tatami e la cultura della colazione giapponese a tariffe competitive con gli hotel business standard. Noku Kyoto, nell'area di Nijo, è il miglior esempio in città di un'autentica esperienza di ryokan economico — vero tatami, accesso all'onsen e un accogliente orientamento per gli ospiti internazionali non familiari con le usanze dei ryokan.
La strategia più importante per un budget a Kyoto è il trasporto. L'abbonamento giornaliero per l'autobus da ¥700 copre il 90% delle destinazioni turistiche con un unico pagamento giornaliero — Kinkakuji, Ryoanji, Ginkakuji, Arashiyama e la maggior parte degli altri siti chiave sono tutti accessibili in autobus. Gli hotel economici vicino alla stazione di Kyoto aggiungono la comodità della JR: Fushimi Inari si trova a 2 fermate a sud (¥150), rendendo l'area della stazione la base economica più strategicamente efficiente per un giro turistico completo.
Le stagioni intermedie e di bassa stagione (gennaio–febbraio, giugno, novembre escluso il picco del foliage) offrono le migliori tariffe economiche. La stagione della fioritura dei ciliegi (fine marzo a metà aprile) e il foliage autunnale (metà novembre) vedono le tariffe raddoppiare all'incirca — evitate questi periodi se il budget è il vincolo principale. La città è altrettanto bella nei mesi più tranquilli e considerevolmente più facile da visitare senza la folla.