La geografia culinaria di Santorini segue il bordo della caldera e i villaggi agricoli interni in modi che dividono l'esperienza gastronomica drammaticamente. I villaggi in cima alla scogliera di Oia, Imerovigli e Fira sono il luogo dove i ristoranti con vista sulla caldera offrono ambienti spettacolari e, spesso, prezzi all'altezza. La qualità varia considerevolmente — molti dei ristoranti con vista sul tramonto hanno imparato a vivere di rendita sulla loro vista — ma i migliori tavoli qui sono davvero straordinari: Metaxy Mas, vicino a Exo Gonia, serve meze greci con una tale precisione stagionale e attenzione agli ingredienti locali da essere diventato uno dei ristoranti più citati in Grecia; Selene a Pyrgos, il villaggio collinare interno dell'isola, è il tavolo di alta cucina più serio dell'isola, dedicato agli ingredienti di Santorini dal 1991.
I villaggi interni — Pyrgos, Megalochori ed Emporio — rappresentano un registro completamente diverso. Queste sono comunità santoriniane attive dove le taverne locali servono la cucina tradizionale dell'isola senza il sovrapprezzo della caldera. Pyrgos, un villaggio medievale ben conservato nel punto più alto dell'isola, vanta numerosi eccellenti ristoranti e kafeneion (caffetterie tradizionali) dove gli uomini del posto giocano a backgammon e il cibo è preparato da persone che hanno gustato questa cucina per tutta la vita. Canava Roussos, una cantina e taverna a Kamari, serve Assyrt
Gli ingredienti unici di Santorini meritano un'attenzione approfondita. La Fava — una purea di piselli gialli spezzati, ricavata da una varietà specifica coltivata solo a Santorini — è uno dei piatti più semplici e soddisfacenti della cucina greca, servita con capperi, cipolla e olio d'oliva. I pomodorini dell'isola (tomatoaki), essiccati al sole estivo, sono intensamente dolci e utilizzati in ogni preparazione, dalle insalate ai tomatokeftedes (frittelle di pomodoro) che compaiono in ogni menu di meze. Il Chlorotyri (formaggio bianco fresco), i capperi di Santorini provenienti dalle piante simili a viti che crescono dalle pareti della caldera, e il bianchetto fritto in olio d'oliva sono tutte preparazioni locali distintive.
Il vino è il prodotto gastronomico più eccellente di Santorini. L'uva Assyrtiko, coltivata nell'antico sistema di allevamento a kouloura (vite a cesto) che protegge le viti dal vento dell'Egeo, produce vini bianchi secchi di straordinaria mineralità e acidità tagliente, che si abbinano perfettamente ai frutti di mare. Domaine Sigalas, Gavalas Winery ed Estate Argyros sono i produttori più celebri; i tour enologici che offrono combinano passeggiate tra i vigneti, degustazioni in botte e panorami che rendono visibile l'agricoltura interna dell'isola in un modo che i ristoranti in cima alla scogliera oscurano.
L'eredità peschereccia di Santorini rivive ad Ammoudi Bay, sotto Oia — il piccolo porto alla base di 300 gradini scavati nella scogliera è circondato da taverne di pesce dove il pescato arriva direttamente dalle barche ormeggiate al molo. Il polpo che si asciuga al sole sulle corde, il dentice rosso alla griglia e l'insalata di ricci di mare alla Sunset Taverna o al Roka sono le esperienze culinarie più autenticamente greche dell'isola.
