Mykonos Town — Chora — è il cuore indiscusso dell'isola, e soggiornare nel suo labirinto imbiancato a calce vi pone vicino a tutto senza necessariamente pagare prezzi premium per la vista mare. Strade come Matogianni ed Enoplon Dynameon sono fiancheggiate da edifici drappeggiati di bougainvillea che celano una sorprendente varietà di piccole pensioni e hotel a conduzione familiare. Molti offrono semplici camere cicladiche — soffitti a cupola blu, testiere dipinte a mano, pavimenti in pietra — che sono autenticamente affascinanti piuttosto che compromessi di budget.
L'area di Ano Mera, all'incirca al centro dell'isola, è dove un numero crescente di viaggiatori attenti al budget sta scoprendo un reale valore. Il villaggio ha la sua piazza centrale, un monastero risalente al 1542, e una manciata di taverne che servono autentico cibo greco a prezzi locali — un gradito contrasto con il rincaro turistico in città. Gli autobus da Ano Mera a Mykonos Town circolano frequentemente durante la stagione estiva, rendendola una base del tutto pratica.
Ornos e Tourlos, entrambi a pochi chilometri dalla città, offrono un'altra categoria di opzioni convenienti: piccoli hotel in stile appartamento con accesso alla piscina dove famiglie e gruppi trovano un ottimo rapporto qualità-prezzo. La spiaggia di Ornos stessa è calma e riparata, ideale per nuotare, e la striscia di taverne sulla spiaggia è molto più economica di qualsiasi cosa a Psarou o Nammos.
Per la fascia più economica del budget, Mykonos Backpackers (vicino alla spiaggia di Paraga) e una manciata di proprietà in stile ostello vicino al Porto Vecchio si rivolgono a viaggiatori più giovani che privilegiano la posizione e l'atmosfera sociale rispetto ai bagni privati. Prenotate questi con largo anticipo — Mykonos ha una delle offerte di alloggi più limitate nelle Cicladi, e anche le camere modeste scompaiono entro marzo per luglio e agosto.
Il tempismo è fondamentale. La stessa camera che costa €90 a fine maggio o inizio ottobre potrebbe costare €250 in pieno agosto. La bassa stagione di Mykonos — all'incirca da metà maggio a metà giugno e da settembre a ottobre — offre il punto ideale di bel tempo, folle meno numerose e prezzi che rendono l'intera isola accessibile.