Le spiagge di Mykonos si distribuiscono lungo la costa meridionale e sud-orientale, collegate da una tortuosa strada costiera che è centrale per il ritmo estivo dell'isola. Le coste settentrionali e orientali sono più ventose — il meltemi (il vento da nord) colpisce queste rive con maggiore intensità — rendendo le baie meridionali la posizione preferita per nuotare in acque calme e per lo sviluppo dei beach club.
Psarou Beach è il tratto più glamour dell'isola — una piccola baia a forma di ferro di cavallo con acque cristalline, Nammos Beach Club (il più famoso dell'isola) e una clientela che arriva in yacht tanto spesso quanto via terra. I lettini a Psarou costano più che in qualsiasi altra spiaggia dell'isola, e la scena sociale è Mykonos nella sua forma più concentrata. Santa Marina Resort è l'unico hotel di lusso con prossimità diretta a Psarou.
La Baia di Ornos (sede di Santa Marina e di diversi hotel di fascia media) offre un'alternativa più calma e riparata — buon nuoto, un piacevole villaggio con passeggiata e una varietà di ristoranti che servono una clientela internazionale mista piuttosto che l'esclusivo e glamour pubblico di Psarou. Agios Ioannis Beach, riparata da un promontorio e di fronte a Delos, è la spiaggia più tranquilla nelle vicinanze dei resort.
Elia Beach, sulla costa meridionale, è la spiaggia più lunga dell'isola — 600 metri di sabbia bianca con il pieno sviluppo di beach club ma più spazio per persona rispetto alle baie settentrionali più piccole. Myconian Utopia Resort è posizionato sopra Elia. Le spiagge di Super Paradise e Paradise, più a est, sono le più famigerate dell'isola — sezioni nudiste e "clothing-optional", rumorosi bar sulla spiaggia e una folla prevalentemente giovane e internazionale. Nessuna delle due ha accesso immediato a hotel di lusso.
Per le famiglie, Ornos e Agios Ioannis sono le scelte giuste: acque calme e riparate, hotel orientati alla famiglia e nessun rumore da beach club. Per i visitatori giornalieri dei beach club, basati a Mykonos Town, Psarou e Paradise sono accessibili con un regolare taxi marittimo dal lungomare della città.
Il vento meltemi, che soffia forte da nord a luglio e agosto, può chiudere alcune spiagge ai bagnanti. Ornos, Agios Ioannis e Psarou sono le più riparate e rimangono balneabili in tutti i giorni tranne quelli più ventosi.
